流式細(xì)胞儀主要由流路系統(tǒng)、光學(xué)系統(tǒng)和電氣系統(tǒng)三部分組成。流道系統(tǒng)具有接收樣品并將其流入流通池的功能，激光束從由光源、透鏡、濾光器和檢測(cè)器組成的光學(xué)系統(tǒng)施加到流通池，產(chǎn)生光光電流。

然后，該系統(tǒng)檢測(cè)細(xì)胞發(fā)出的熒光，并使用電氣系統(tǒng)對(duì)其進(jìn)行分析。流路系統(tǒng)由管道、閥門和泵組成，用于將樣品中漂浮的熒光標(biāo)記細(xì)胞排列在一條線上進(jìn)行分析。

當(dāng)激光穿過細(xì)胞的被稱為詢問點(diǎn)的部分時(shí)，光被散射，同時(shí)通過激發(fā)與細(xì)胞結(jié)合的熒光染料而發(fā)射熒光，并且該散射光和熒光被裝置檢測(cè)。它作為一個(gè)信號(hào)。散射光有兩種類型：前向散射光信號(hào)（FS）和側(cè)向散射光信號(hào)（SS）。

使用不同的檢測(cè)器檢測(cè)FS和SS，F(xiàn)S反映細(xì)胞大小，SS反映細(xì)胞內(nèi)結(jié)構(gòu)。檢測(cè)到的信號(hào)在電子系統(tǒng)中轉(zhuǎn)換成數(shù)據(jù)，最終可以由軟件解釋。